在茫茫的黑夜中，一个巨大的基地屹立在大地之上。而一旁的山上，正潜伏着一个男人。男人长着一头棕色长发，留着络腮胡，穿着一身作战紧身衣正用望远镜打量着面前的基地。这个男人便是美国最强人类特工，snake。
snake放下望远镜并拿出终端机打通左眼的连线并对左眼说：“我已经来到了敌方的基地，我现在需要这个基地的地图。”左眼二话不说便给了基地的地图并告诉snake：“那五份密报分别被放在司令室、指挥室、上尉的卧室以以及两份放在F4仓库。另外由于汉克和幽灵去参与另外两个行动了，也就是说这次的任务你不会有任何支援。”
snake回答：“有些时候一个人也不错。”snake正准备起身去往敌人的基地，左眼却让他继续趴着，snake有些不明白，左眼则回答：“我们有一种好方法可以让你迅速到敌方基地，但是能降落在哪全看自己的运气了。”
snake大概率知道左眼干什么了但是为时已晚，只见他的背包里突然弹出降落伞自己便飞了起来，突然snake被伞带得飞向云霄，等到了基地上方背包才自然脱落，但是snake看就不好受了。
snake从空中坠落到了敌方的基地，他想：我也许可以认为这是富尔汗教授这辈子最失败的发明，没有之一。”snake狼狈地爬了起来发现自己似乎在基地内部，因为自己身后就围着电网而目前就是大门。
snake不可置信地打开了终端机，他发现自己只要进入大门再穿过走廊在打开大门便可以找到两份密报了。snake小声地说：“老家伙的发明终于有一次派上用场了。”他打开大门并延着走廊走向F4仓库的门前，snake却发现需要密码才可以进去。不够这难不倒他，他立刻从兜里掏出透明胶带撕下一小段兵粘在按键上，果然指纹出现在了透明胶带上。
指纹出现在了4、2、1三个数字是，而1的指纹明显比4与2的清晰不少，那么1肯定就是按了两下的那个数字了。就这四个数字可以组合出不下10种密码，显然这是专门提防自己的。不过snake倒是想到了一种比较有可能的结果喽：
如果snake没有记错的话，上校的第一次庆功宴在1942年的一月一日举办过，也就是说4211的可能性非常大的，不过也许她们正好揣测到了这一点这个密码毫无疑问就是陷阱，首相排除这个；并且1按了两下并不代表是同时按下的，那么1可能并不是相连的，中间要么隔离两个数字，要么隔了一个数字。如果按上校的性格立刻他最喜欢2那么第一个数字毋庸置疑。
不过snake却有了新的发现，没错2+1+1正好等于4，那么4就是结果也就是最后一个数字，那两个1放在中间便得到了密码是2114。没想到密码居然真的是对的，snake都有些惊讶，虽然自己想过答案会是这个但是他认为如果真的这么思考那么毫无疑问就是把自己当傻子了……
snake进入了F4仓库，眼前的一个桌上摆着一个保险箱，并且保险箱上了密码锁周围也没有关于密码的线索。snake只能翻箱倒柜地寻找密码，终于在垃圾桶里找到了半拉密码，只能看清最后两个是5和3，前面一个被撕得几乎看不出来是什么。
忽然脚步声响起，snake立刻躲到门旁边，那个人打开大门，门打开时与墙形成的夹角正好可以把snake好好地隐藏群里。那个人手里恰巧有那半拉密码，不过他正在寻找剩下半拉密码。snake则瞅准时机轻轻推开门留些缝隙再将半拉密码丢出去，那个人见到立刻捡起并来到桌前拼好了密码，snake也不再躲藏立刻拔枪射中那个人的后颈，那个人当初晕了过去。
snake则用拼好的密码打开了保险柜得到了其中的两份密报，剩下的三份他拔了这个人的衣服并戴上人皮面具伪装成这个人随后锁上大门向司令室走去。
他先是假借保管密报的理由博得了司令的信任并轻松拿全了密报，正当snake来到大门前时，司令却带人围捕了他，原来司令看出来这个人是伪装的。不过snake也是有备而来，他立刻在自己脚下丢出烟雾弹并用麻醉枪放倒了司令自己再趁乱离开了基地扬长而去，只留下一脸懵逼的众人。
snake呼叫了直升机并在安全的区域等待直升机将自己接回去……
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