皇上知晓了身世隐情后，看到遍体鳞伤的三个姑娘，心中很是心疼。他终于认了紫薇这个女儿，这场风波也暂时告一段落。然而，新的麻烦却接踵而至。回疆的公主含香随父母来宫晋见乾隆皇帝。含香，她宛如仙子下凡，美丽动人，尤其是她身上那独特的香味，让人闻之难忘。在她来宫的途中，麦尔丹欲劫持她，但未成功。麦尔丹躲进了会宾楼，不巧被小燕子发现，二人不打不相识。原来，含香早已心许麦尔丹，她对皇上的宠爱毫无兴趣。小燕子、紫薇等人得知后，决定帮助含香出宫，与麦尔丹团聚。
我的母亲愉妃，她一直极其不喜欢小燕子。无论小燕子如何讨好，她都不为所动。而大方得体、漂亮贤惠，又出身贵族的欣荣，深得太后与愉妃喜欢。她们一心想要我迎娶欣荣，可我的心中只有小燕子。会宾楼众人商议着我和小燕子的出走计划，我深知这一走，便可能再也无法回到这皇宫。但为了小燕子，我愿意放弃一切。然而，在我诀别母亲时，愉妃伤心地上吊轻生。小燕子向含香取得凝香丸，救活了母亲。看着母亲苍白的面容，我心中充满了愧疚。最终，我无奈被迫迎娶欣荣，但在大婚之夜，我拒绝与她圆房。
含香因拒受宠而刺伤皇上，太后一怒之下要赐死香妃。含香喝下毒酒后，意外去除了香味。小燕子等众人趁机营救香妃出了宫。皇后一直不肯放过两位格格，她秘密派太监去威胁紫薇的舅公舅婆，让他们指认紫薇不是皇上的女儿。皇上一怒之下，把两位格格关进牢房，还判了她们死罪。我与班杰明等人想尽办法，终于把两位格格救了出来。从此，我们一群人在宫外谋生。
皇上下令活捉众人回来亲审。在逃亡的过程中，晴儿和紫薇被追兵劫持受伤。萧剑及时出现，救出了晴儿，并悉心照顾她。而紫薇，不幸失明，她崩溃不已，一直封闭自己。尔康守在她身边，向她诉说心声，发誓永远不会离开她。在尔康的陪伴下，紫薇逐渐恢复了信心，过了不久，她的眼睛也复明了。
众人在逃亡途中，开始学着赚钱谋生。然而，我们却遭遇了黑衣人刺杀，险些逃过一劫。萧剑向小燕子坦白了她的身世，原来萧剑是她的亲哥哥，他们的父亲是浙江巡抚萧之航，但父母皆已离世。皇上得知皇后追杀众人后，大怒，立刻把紫薇的舅公舅婆召进宫。他们澄清了紫薇的身份，紫薇确实是皇上的女儿。
皇上亲自来到了大理，接小燕子等人回宫。然而，众人拒绝回宫，我们害怕宫里的阴谋迫害，决定在大理开启新的生活。萧剑告诉小燕子，乾隆是杀父仇人。皇上得知此事后，遂彻查小燕子父亲的案件，并表示无论如何都不会牵连小燕子。经过调查，原来萧剑的父亲是被人诬陷的，皇上下令处死了陷害其父的人，萧剑大仇得报。
宫中来信称愉妃病危，叫我回去尽孝。我看着信，心中矛盾不已。我反复回想信中的内容，小燕子希望我能承担起属于我的责任。在痛苦的两难抉择中，我们定下了两年之约，暂时分离。班杰明愿意去大理，我托付他照顾小燕子。我与紫薇同皇上回宫，皇上处罚了皇后，命她不得出其宫门半步。
晴儿和萧剑在大理举行了婚礼，他们的幸福，让我心中既欣慰又有些许羡慕。皇上封紫薇为“明珠格格”，并给她和尔康指婚。我回到宫中后，欣荣又开始准备我们圆房。那天晚上，我喝下欣荣备的药酒后，迷迷糊糊中把她当成了小燕子，犯下了大错。欣荣诞下一子后，我终于下定决心，告别了皇帝，出宫去寻小燕子。
当我再次见到小燕子时，她依旧是那副灿烂的笑容，仿佛这两年的分离从未存在过。班杰明看到我回来后，便把对小燕子的这份喜欢默默藏在心里，深深祝福着我们。他告别众人，独自离去。看着他离去的背影，我心中对他充满了感激。
如今，我与小燕子在大理过上了平凡而幸福的生活。回首往事，那些在紫禁城的日子，仿佛是一场遥远的梦。而我，也终于挣脱了宫廷的束缚，找到了属于自己的爱情和自由。
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