王太后阿美斯频繁干涉国政,引起了美加巴佐斯的不满,原本美加巴佐斯已经答应希腊俘虏,会保证他们的安全,但是阿美斯为了给自己的叔叔阿奇美尼斯报仇,强烈要求国王处死他们,尽管美加巴佐斯拼命争取,但是国王最终还是处死了他们,这一情况让他本人的名誉遭受沉重的打击,它在整个当时的世界里面都是响当当的,都知道他信守承诺,但是现在他说出的承诺却无法办到,对他来说是个打击,公元前450年,他在自己的两河流域发动叛乱,在国王的同意下,奥西利斯率领大军讨伐,结果被打败,但是美加巴佐斯并没有伤害他,相反还很优待,两人竟然还成为了好朋友
后来,国王又让美诺斯塔斯去进攻,结果仍然失败,连主帅都身负重伤,经过两次辉煌的胜利,他很满足,本来他就是因为一时生气才背叛的,并没有篡权夺位的野心,见好就收,他派人向国王投降,但是前提条件是,他仍然在自己的辖区内,国王原谅了他的叛乱行为,把他带到皇宫,侍奉国王,一次狩猎中,他在凶猛的狮子口下救下了国王,但是国王却说竟敢在自己面前无视死亡的痛苦,杀死一个动物,想要杀死他,它的女儿求情,于是把他关到了库尔塔,放逐了支持他叛乱的阿尔托克梅斯,他的儿子佐皮鲁斯公开叛乱,公元前441年,佐皮鲁斯来到了雅典,取得了雅典的支持,然后去攻打小亚细亚的卡洛斯,但是卡洛斯拒绝投降,佐皮鲁斯在攻城的时候意外去世
美加巴佐斯受了五年的煎熬,由于患上麻风病,他和妻子来到了苏萨,国王原谅了他,没有人认为他是个威胁,76岁那年,他去世了