几周前。
板木正坐在办公室里，审视着手下的各项行动。由于干部拉姆达的无能，成功的案例寥寥无几，失败却一大堆。‘得把这蠢货派去城都的某个基地。虽说不情愿，但那家伙多少还有点用，尤其是他那无人能及的伪装术。’
刚想到这儿，他又琢磨起来：‘不知道小银过得怎么样……’可念头刚落，阿桔就走进了房间。板木本以为会听到好消息，毕竟阿桔算是他的二把手。但阿桔一开口，他的怒火就蹭地冒了上来。
“老大，很抱歉通知您，‘恐惧计划’的实验体跑了，因为拉姆达觉得那东西毫无价值。” 板木一听，气得眼前发黑，怒吼道：“把那个废物给我带过来！” 阿桔立刻示意几个手下押着拉姆达进来。
拉姆达被强行推进屋，还嘴硬：“多大点事啊，不就是只没用的老鼠吗？” 这话彻底点燃了板木的怒火：“你就没看报告吗？那只老鼠比你这废物有价值多了！这辈子都是！那是为了对抗超梦计划专门强化过的！给我滚！你被调到城都分部，去个跟你一样没用的基地…… 不，这么说太侮辱基地了。”
拉姆达被拖出去后，板木对着麦克风宣布：“所有人暂停当前任务，‘恐惧计划’实验体已逃脱。谁能把它带回来，立刻晋升为干部，不惜一切代价抓回那只老鼠！”
接下来的几天，整个火箭队都在搜寻 “恐惧计划” 的实验体，却一无所获。
一只黄色的小老鼠在森林里狂奔，从囚禁中逃出来后，它已经精疲力尽，仿佛下一秒就要倒下。突然，一条阿柏蛇从灌木丛里滑出来，猛地扑了过来。
绝望和恐惧之下，皮丘拼尽全力放出了电击。攻击成功吓退了阿柏蛇，但这一下加上身上原有的伤，让它几乎站不住了。这时，它听到了火箭队队员的声音，还有瓦斯弹的低吼。它吓坏了，强撑着继续跑，没注意到前方的悬崖。脚下一滑，它掉了下去。
但就在它即将摔得更惨时，一只袋兽接住了它。母袋兽把这只小老鼠带回了族群，和她的宝宝还有其他袋兽待在一起，还给了它一些草药和浆果。于是，皮丘决定留在这对母子身边。
......
宝可梦夏令营的日子到了，其实算不上夏令营，更像是在真新镇外的森林里探险。小智早就醒了（这次没把闹钟砸了），穿戴整齐，准备出发。生日前几周，妈妈问他想要什么礼物，他早就想好了，要一个精灵球，万一遇到愿意跟他走的宝可梦，就能收服了。
他本来没抱太大期望，毕竟小孩子大多会这么要求。但生日那天醒来时，床边竟然放着一个精灵球，而且还不是普通的球，是一个漆黑锃亮的豪华球。他开心坏了，虽然不知道妈妈是怎么弄到的，但他没问，只是紧紧抱住了花子。
他冲出家门，背包在身后颠颠作响，径直奔向大木博士的研究所。到了地方，发现大家都已经到了，连小春身边都多了个陌生面孔。小智挥挥手：“嘿！我来了，大木博士！” 所有人都看了过来，大木博士爽朗地笑了：“你好啊，小智！来得正好，再晚一步我们就不等你啦！” 他开玩笑道。
小智跑到队伍里，假装刚注意到小春身边的男孩，故作惊讶地问：“嗨，小春，这是你的朋友吗？”他得忍住差点露出来的嫌弃，说实话他真挺不喜欢小豪的，但为了找借口溜走（到时候还能甩锅给小豪），又必须让他在这儿。
小春回答：“嗨，小智，这是小豪，也是枯叶市的。你之前说让我带个人来让旅途更有意思，小豪正好想来。他有时候会来看我爸爸做研究。”
小智转向小豪，笑着伸出手：“很高兴认识你，小豪。我是真新镇的小智，希望能好好相处。”他得用尽全力才没表现出真实想法，他就是个坚定的 “反小豪派”，才不会改变呢。
小豪握住他的手，笑着说：“原来你就是小智啊，小春跟我说过你，说你可能是学校里最努力的孩子。不过我打赌，你懂的肯定没我多。” 说完还扬起下巴，好像刚赢了辩论似的。
小智还没来得及回嘴，大木博士就拍了拍手：“好了各位，出发吧！越早走越早回，咱们走！”
森林探险开始了，大木博士时不时停下来讲解各种宝可梦的习性、栖息地和属性。但小智的注意力更多放在观察周围的宝可梦上：巴大蝶从身边飞过，一群嘟嘟和嘟嘟利在池塘边吃草，森林深处还有一群野生的妙蛙种子和杰尼龟在树荫下休息。
‘看来这就是大木博士给新手准备初始宝可梦的地方啊。真搞不懂他当初为啥不直接告诉小智等会儿，自己再去拿一只，或者干脆多备几只呢。’小智正想着，小豪已经开始在其他孩子面前炫耀他的宝可梦知识了。
这时，他看到两个训练家：一个穿粉色裙子的女孩带着杰尼龟，一个穿红色背心的男孩带着妙蛙种子。女孩正在和一只绿毛虫对战，杰尼龟使出泡沫光线后，她立刻扔出精灵球收服了绿毛虫。其他孩子都很惊讶，大木博士趁机讲解起收服的原理。
当天色渐晚，他们遇到了一只大葱鸭。大木博士说所有宝可梦都会进化，小豪立刻开始抬杠：“可这只大葱鸭就不会进化啊！不是所有宝可梦都能进化的，好多都不行。”
小智心里想：‘切，正好杀杀他的气焰。’于是开口道：“谁说的？没见过大葱鸭进化，不代表它不能进化啊。正因为这样，才需要大木博士这样的研究员去发现宝可梦的新知识。说不定所有宝可梦都能进化，只是我们还没找到方法而已。”
说完，他看到了各种反应：大木博士投来欣慰又赞赏的目光，孩子们看他的眼神像在看哲学家，小豪一脸惊讶还有点尴尬，小春则一脸无奈 —— 她太了解小豪这毛病了。
探险继续进行，大木博士带着大家走过一座桥，开始讲解水系宝可梦。这时，小智、小豪和小春落在了后面。
小春先开口：“小豪，你不该打断别人说话的。难怪你没朋友。”
小豪反驳：“谁说我想要朋友了？而且我有你，现在还有小智当朋友呢。我真正想要的，是收服一只没人见过的宝可梦。”
小春叹了口气。小豪却开始争辩：“别笑话我，这是我的宿命，我感觉未来就在我掌心呢。你相信我吧，小智！”
可没等小智回答，就听到一声巨响。他们往树丛那边一看，只见一只巨大的尼多王正在和一只娇小的、似猫似鼠的宝可梦对战。当然，只有小智知道那是梦幻。
尼多王打急了，它先使出了大地之力，却被梦幻轻松躲开；更糟的是，梦幻竟完美复刻了这招回敬给它，打得尼多王节节败退。
小豪见状大喊：“它居然用了那只尼多王的招式，而且比尼多王用得还好！”
尼多王缓过来后，试图用暗影球，结果又没打中，还被梦幻用暗影球反击，打得只剩一口气。它最后想试试冰光束，依旧失败，反被梦幻用冰光束彻底打倒。而梦幻全程像在玩游戏，笑得像个孩子，尼多王一晕倒，它就飞走了。
小豪想都没想就追了上去。
小春喊道：“小豪！别乱跑！”
小智也跟了上去，虽然不喜欢小豪，但这可是他等了好久的机会。他们跑到一片开阔的田野，小豪停下脚步四处张望。
小春追上来说：“小豪，你不能这样跑开。我们不该在这儿，得赶紧回大木博士那儿去。”
可他们还没动，一只电击兽就从树后走了出来。但它突然一闪，变成了梦幻。
"是梦幻！"三人惊呼未落，梦幻又飞奔跑了，三人立刻追了上去。梦幻变成嘟嘟利在平原上狂奔，接着跳进河里变成暴鲤龙顺流而下。小豪大喊：“站住！你跑不掉的！”
这场疯狂的追逐把他们引到了森林深处，最后来到一处悬崖边。就在这时，他们突然听到了一只袋兽宝宝坠落的惊叫声、母袋兽绝望的呼喊声，还有一只小小的、吓坏了的皮丘的叫声“皮-丘~”，在树林里回荡。
就在片刻前，这小小的一家人还在安静地享受时光，吃着觅食来的浆果和草药。袋兽宝宝好奇心旺盛，精力又足，不知不觉走得离族群太远了。而皮丘，一直像个小护卫似的，立刻跟了上去想阻止它。
“皮-丘！” 它发出警告的叫声，想让宝宝停下来。
可袋兽宝宝已经在悬崖边摇摇晃晃了。皮丘急忙冲上前，总算赶在最后一刻抓住了小家伙，可脚下的泥土却突然崩塌。
两个小家伙一起坠了下去。
“皮-丘~！” 小老鼠发出撕心裂肺的尖叫，和袋兽宝宝一起朝着下方布满岩石的林地坠落。
就在这一瞬间，小智、小豪和小春赶到了。当看到两只幼崽朝着水面坠去时，他们立刻意识到， 这么小的宝宝，绝对经不起这样的撞击。
小豪吓得僵在原地，小春惊恐地捂住嘴，小智却咬紧牙关冲了过去。“撑住啊！” 他大喊着甩掉背包，纵身一跃追了上去。
小春尖叫道：“小智，不要！”
小豪伸手去拉，却已经来不及了。“他到底在干什么啊？！”
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