第1集
星宇在十岁生日的那天从乡下来到星河市，在命运的安排下，他在哥哥星原的CBF研究所里遇到了兽车人龙威。不明情况的星宇又与心怀不轨的欧阳浩相遇，进行了第一次兽魂决斗，并且最终取得了胜利。
第2集
初来乍到的星宇来到学校，遇到了性格张扬的同班同学龙一飞，和他的兽车人雄霸。两人展开兽魂决斗。他们俩的对决十分激烈，龙威和雄霸都实力强劲，双方打的难分难舍，一时间胜负难分。不过和龙一飞相比，星宇显得十分沉着冷静，最终他战胜了龙一飞，不打不相识的两人也成了好朋友。
第3集
星宇遇到了数据狂人阿卫，还有兽车人灵风。阿卫不停收集星宇的资料，准备进行兽魂决斗。星宇发现阿卫和灵风是很强的对手，但阿卫只信任自己的数据。最后星宇和龙威一起用友谊的力量战胜了阿卫，给阿卫上了关于友谊的一课，而阿卫也终于明白了灵风对自己的重要，留下了友谊之泪。
第4集
星宇和龙一飞遇到了剑道少年易寒，星宇决定改变易寒对兽车人的看法，他和易寒进行兽魂决斗。面对强大的对手，星宇陷入苦战。星宇发现易寒和虎魄虽然很强，但易寒只是把虎魄当成他的剑，而并非是同伴。然后星宇和龙威一起用友谊的力量战胜了易寒，也让易寒明白虎魄是自己的朋友。
第5集
星宇等人发现，有人利用兽车人谋取利益，于是决定追查下去，结果他们遇到了不良少年张宅宅。星宇等人与张宅宅进行兽魂决斗，在战斗中，张宅宅的兽车人巨角牛不再听从张宅宅的命令。最终张宅宅被星宇和龙威打败，而张宅宅也决定改邪归正，巨角牛这才回到了他的身边。
第6集
星宇等人和天才少年小司狭路相逢，小司和他的兽车人魔翎向星宇发起挑战。星宇与小司的兽魂决斗异常激烈，小司和魔翎给星宇带来了前所未有的压力，星宇和龙威经过艰难的战斗，终于打败了小司和魔翎。但是尝到失败滋味的小司并不服输，他愤愤不平的离去。
第7集
星宇等人遇见了大川小川两兄弟，大川过度的保护欲让小川觉得很不舒服，于是星宇决定用兽魂决斗让小川证明自己。星宇和小川对战龙一飞和阿卫，并且取得了最后的胜利，而小川也向大川证明了自己的能力，让大川刮目相看，最终两兄弟学会了互相理解和信任，重归于好。
第8集
星宇等人得知最近出现了神秘的兽车人杀手，于是他们展开调查。星宇和易寒遭遇欧阳浩，易寒和虎魄面对欧阳浩和鲨达斯，欧阳浩使用神秘的X能量卡后，鲨达斯实力大增，但还是被易寒和虎魄打败了。星宇等人意识到这次的事情没有那么简单……
第9集
星宇等人结识了新同学连夏，热心的星宇想和连夏做朋友，但没想到连夏竟然是暗夜猎团的人。星宇和龙威与连夏和彩信展开战斗，经过激励的战斗，龙威的情况虽然很危险，但还是反败为胜。
第10集
宇等人打败连夏之后，龙一飞邂逅了一个叫做叶蝶的女孩，两人很快成为了好朋友，然后在星宇等人面前，突然出现了神秘的对手。叶蝶原来是暗夜猎团的人，星宇等人和叶蝶进行战斗，他们的情况十分危险。最后虽然取得胜利，面对朋友们的质疑，龙一飞却认为叶蝶不是坏人。
第11集
为了打败暗夜猎团，易寒加入星宇等人一起备战，星宇在战斗中用行动告诉大家，力量不是一切，决心和勇气才是获胜的关键。另一方面，在易冰的强大实力面前，小司再次尝到了失败的滋味，为了追求力量，他最终心甘情愿的加入了暗夜猎团。
第12集
校园里发生了一件怪事，正值盛夏，但学校教室里却寒气逼人，星宇等人经过调查，发现罪魁祸首，是一只具有冰冻力量的兽车人。龙威艰难战胜了冰冻力量的兽车人，发现了X能量卡。这只兽车人声称自己是被陌生人拐走的，它请求大家帮它找回主人，最后连夏出现，将这只兽车人带走了。
第13集
星宇等人得知有很多猎车手的兽车人神秘失踪了，于是星宇等人帮助星原，开始寻找失踪的兽车人的线索，调查事件的真相。星宇等人团结合作，用计谋让一个绑架兽车人的猎团手下上当，可是被猎团手下察觉，星宇等人追击之后，还是被他逃脱了。
第14集
星宇等人猜到是狂暴化的兽车人作怪，于是下定决心一定要抓住兽车人，调查出事件的真相。星宇等人打败了狂暴化的兽车人超音蝠，大家终于得知了猎团的真正目的，那就是利用兽车人牟取暴利。听完了超音蝠的陈述后，星宇等人决定要解救被掳走的兽车人们。
第15集
小川的兽车人穿山甲也失踪了，大川小川兄弟前来求援，星宇等人帮忙调查，但调查才刚展开，穿山甲就自己回来了，众人疑惑不解。星宇等人为打探猎团的消息，频频与穿山甲接触，然而穿山甲已经被控制，它暗中分化易寒与大家的感情。终于，易寒忍不住与小川决斗，混乱中猎团成员突然出现，将熊霸抓走了……
第16集
龙一飞责怪易寒的鲁莽，熊霸被抓走了，倔强的易寒不认为自己的做法有错，与龙一飞大吵一架后，易寒决定独自寻找地下角斗场的所在之处救回熊霸。易寒进入废弃汽车厂寻找熊霸，却中了猎团的陷阱。星宇三人及时赶到，四人联手击败了猎团成员，然后从猎团成员口中得知了角斗场的所在。
第17集
阿卫为了证明自己，独自与敌人战斗，最后赢得胜利
第18集
星宇赶到楼顶，看到易寒，于是星宇与易冰决战，到底谁会获胜呢？
第19集
星宇终于发现了真正的龙威，却落入了小司的陷阱。龙威被魔翎打败，并大幅吸收龙威的生命能量。小司为了报复星宇，决定在下次的决斗中，再夺取龙威剩下的生命能量。看着伙伴受苦，星宇陷入悲痛中。
第20集
安小司挑衅星宇，使得星宇没有信心对战，于是易寒找到星宇，对星宇进行信心斗争，最后星宇重拾信心，并与安小司决斗，星宇胜利了。
第21集
小司回到暗夜猎团，魔翎为了维护小司的尊严，自愿接受强化。暂时失去了魔翎陪伴的小司很怀念和魔翎在一起的生活，他向易冰提出要脱离猎团，遭到易冰的拒绝之后，小司夺走魔翎，并被猎团成员追捕。星原帮助小司逃出了猎团的重围，并答应他修复魔翎。
第22集
希斯集团突然宣布有智能发明要公布，没想到竟是被暗夜猎团掳走的兽车人，最可怕的是，兽车人的存在从此成了公开的秘密。猎团开发出更强的X能量卡，命令狂暴兽车人向星宇等人发动攻击。在战斗中，连夏带大家从密道逃出，但是为星宇等人断后的龙威等兽车人则全数陷落在狂暴兽车人的包围之中……
第23集
在狂暴兽车人的包围之中，龙威等兽车人奋力反抗，无奈之下分体成兽车形态。星宇等人试图拯救各自的兽车人，但都被昔日的搭档狠狠攻击。关键时刻，龙威和虎魄恢复了少许神智，决心在再次狂暴之前将熊霸和灵风打倒，摆脱X能量的控制，一场殊死战斗展开。
第24集
龙威和虎魄即将重新陷入狂暴之际，龙威等兽车人终于觉醒恢复了原状，并且不需要进入兽魂服务器内即可发挥力量。由于X能量发生器的影响，整个星河市的兽车人都开始陷入狂暴，龙威等兽车人发现希斯集团妄图借此控制世上所有的兽车人，于是众兽车人分头行动，然后虎魄和啸冰相遇了，宿命之战开始。
第25集
星宇等人趁着希斯集团一片混乱趁机潜入，却没想到暗夜猎团早已预料到他们的行动，拦在众人面前的是力量倍增的鲨达斯。面对力量倍增的鲨达斯，阿卫挺身而出，其余人继续进发。鲨达斯和灵风经过激烈战斗，最终灵风使出从X能量中领悟的新绝技，将欧阳浩的鲨达斯击败。
第26集
龙一飞和星宇遭受灰猫的偷袭，得知X能量发生器的发射功率将在一小时后达到最大，龙一飞决定独自拖住叶蝶，星宇到大楼上层去阻止X能量发生器继续运行。龙一飞得到灵感，命令熊霸突破迷宫墙壁进行奇袭，扭转局面。叶蝶回忆起过去的遭遇，最后熊霸取得了胜利，龙一飞谅解了叶蝶，决定留在原地照顾她。
第27集
星宇遭遇连夏制造的幻境的考验，龙威的力量也在不断流失中。小司决定自己留下来迎战连夏，在新生的魔翎彩星面前展现出截然不同的实力，最终小司获胜。连夏开始反省，自己跟随暗夜猎团所做的一切是否毫无意义……
第28集
易寒终于到达希斯集团的顶层，与易冰、啸冰分别展开死斗。然而无论是易寒还是虎魄，都被对方压制。易冰启动了信号加强器，易寒奋力支撑，想要破坏四个信号加强器，但被易冰阻拦。关键时刻，星宇和龙威到达顶层，与易寒和虎魄并肩作战。
第29集
星宇和龙威独立对抗易冰和啸冰，两人在绝境中发动进阶必杀技，终于击败了啸冰，并毁掉了X能量发生器，然而兽车人们正在快速被消灭。一个神秘组织“巨人组织”突然出现在他们面前，这个组织究竟是敌是友？他们的目的又是什么？
第30集
神秘组织巨人突然出现，意图消灭所有在场的兽车人。巨人组织认为人类是唯一的智慧生命体，于是他们想要把兽车人一举灭掉。众人即将被雷煞打败之际，希达突然发现，她并不希望兽车人消失，于是她在关键时刻救下了兽车人们，星宇等人趁机逃跑。
第31集
巨人组织彻底开启兽魂服务器功能，兽魂服务器展开一个巨大的传送门，最终整座希斯大厦都被吞没，巨人组织的人和猎团的人都不知所踪。星宇等人在星原的安排下，一同进入兽魂服务器展开冒险。另一方面，欧阳浩被希斯唆使进入兽魂服务器，欧阳浩别无选择之下答应了。
第32集
星宇一行人遇到巨大兽车人的偷袭，星宇和龙威将巨大兽车人引开，其他人也意外的分成了两派，各自继续向兽魂服务器内世界正中央的X能量塔进发。一飞、叶蝶，连夏遇到狂暴的兽车人，连夏和一飞终于学会倾听彼此的意见，以协作的方式将狂暴兽车人击倒。星宇引开巨大兽车人后希达出现，带星宇逃出困境。
第33集
易冰回忆起以前处处被哥哥压制，十分不忿，于是故意乱发命令。山体崩塌引来狂暴兽车人，易寒遇险，易冰方寸大乱，幸好虎魄和啸冰将易寒救出。在易寒和易冰之间的默契下，虎魄和易寒终于击败了狂暴兽车人。
第34集
星宇和希达从西面进入沙漠地区，希达不慎引来一堆狂暴化兽车人倾巢而出，前来追赶星宇等人。巨人组织首领和雷煞出现，挡住了大家的去路，龙威将狂暴兽车人的注意力引到雷煞身上，趁雷煞被狂暴化收车人们缠住之际，星宇等人趁机逃走。
第35集
小司和阿卫来到了火山地带，经过艰难的寻找，他们终于发现了连接两处断崖的勇气之桥，但只有具备勇气的人才能通过。小司为了掩护阿卫，对抗已变成巨大鲨鱼的鲨达斯，危在旦夕之际，阿卫终于鼓起勇气通过隐形的桥，和小司会合。两人的勇气爆发，让灵风和魔翎吸收了X能量，终于击退了鲨达斯。
第36集
龙一飞、叶蝶、连夏在巨塔里遇到了热情的土著兽车人，龙一飞和雄霸认为休整一天，但连夏认为不能在此浪费时间，双方闹起了矛盾。夜里，连夏试图叫醒龙一飞和叶蝶应对危险，土著兽车人的首领出现，向连夏、彩星和一飞、雄霸发起进攻。连夏利用对方的战术，终于击败了对手。
第37集
易寒、易冰两兄弟来到南方的冰雪荒原，他们被雪犰狳们送到了安全的地方。易寒两兄弟在冒险中逐渐增长感情，但此时大群狂暴兽车人来袭。双方展开激战，易寒等人终于明白为他人而挥剑，最终它们战胜了狂暴兽车人，告别了雪犰狳，继续朝着X控制塔前进。
第38集
星宇、希达、龙威来到一处宽阔的田园，他们在一间房子发现了实验器材，还有兽车人的设计草图，这里让星宇兴奋不已。原来这里就是星宇父亲的实验室，了解到父亲的初衷是让兽车人和小孩子成为快乐的伙伴。巨人组织成员突然出现，并带着狂暴兽车人发起进攻，龙威和星宇陷入苦战。
第39集
星宇、希达、龙威来到一处宽阔的田园，他们在一间房子发现了实验器材，还有兽车人的设计草图，这里让星宇兴奋不已。原来这里就是星宇父亲的实验室，了解到父亲的初衷是让兽车人和小孩子成为快乐的伙伴。巨人组织成员突然出现，并带着狂暴兽车人发起进攻，龙威和星宇陷入苦战。
第40集
易寒易冰兄弟及时赶到，帮助龙威摆脱苦战。巨人组织成员突然展开一个结界，把兽车人们变成了兽车人僵尸，星宇等人再次陷入不利局面。只有将僵尸兽车人的身体彻底粉碎才能打败他们，星宇无法做出决定，关键时刻，一只神秘的兽车人出现，净化了僵尸兽车人，巨人组织成员决定撤退。
第41集
星宇等人终于来到X能量塔前，被强力兽车人拦住。欧阳浩和鲨达斯出现，趁乱冲向X能量塔前的审判之门，想要夺取X能量。审判之门打开了，巨人组织突然出现，星原带着手下抢先进入大门。罗森博士的影像出现，告诉星宇不能被星原抢先决定兽车人的未来，星宇等人一起冲进了X能量塔。
第42集
星宇等人冲进X能量塔，X净化装置开启了倒计时，时间一到将会净化所有的兽魂，而同时，一条从兽魂通往人类世界的传送通道也打开了。星原为了确保X净化装置的启动，出动雷煞向星宇等人发动攻势。双方实力过于悬殊，在危机关头，罗森博士的意识出现，大家继续前行，但巨人组织仍紧追不舍。
第43集
星宇等人来到水晶桥，巨人组织的成员再次出现，对星宇等人发动攻击。水晶桥断裂，阿卫、小司、巨人组织成员一起跌入深渊。小丑兽车人让希达做出艰难的选择，希达拒绝，龙一飞虎趁机偷袭，并救出了星宇等人。小丑兽车人最终选择相信星宇他们，星宇等人继续前进。
第44集
星原讲起自己的过去，父亲研究兽车人时，雷煞突然觉醒暴走，导致研究所爆炸。星原的计划已经是最后阶段了，不会让其他人来阻止自己的步伐。星宇等人不断前进的时候，也重新和小司、阿卫他们相遇，大家一起向目的地前进。
第45集
兽魂界毁灭在即，星宇为了维护兽魂界不惜与星源对抗。最后星宇他们的兽车人全部牺牲。
第46集
由于星宇他们的兽车人全部牺牲时，星宇的爸爸出来化解危机，并且让星源他们兄弟和好；兽魂界即将消失，星宇爸爸送他们回去。而且他们的兽车人也回来啦。从此星宇兄弟俩和睦。并且星宇他们组成兽车人巡逻队一起维护兽魂界和地球。
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