黑白

主角会随剧情得到对应的版本的龙之石，打败四天王后，来到N的城堡之上，莱希拉姆或捷克罗姆会随剧情从从龙之石中苏醒，主角要捕捉莱希拉姆或捷克罗姆。在黑版中要捕捉莱希拉姆与N的捷克罗姆对战，白版则反之。

若在捕捉时队伍中和电脑内全部存满宝可梦以至于无法捕捉莱希拉姆或捷克罗姆时，将其击倒，剧情结束后，则会在龙螺旋之塔的顶端再次出现。

酋雷姆会出现在巨人洞窟里。

酋雷姆会在剧情中被等离子队抓走，之后在巨人洞窟中被控制与N的莱希拉姆或捷克罗姆融合，黑版2是暗黑酋雷姆，白版2则是焰白酋雷姆，主角要将其击倒并解放。

进入殿堂后，跟从索罗亚克来到N的城堡里，会再次遇见N并可以与其对战，战胜N后，N会将莱希拉姆或捷克罗姆变回龙之石交给主角。之后携带对应的龙之石来到龙螺旋之塔的顶端则可以再次唤醒莱希拉姆或捷克罗姆并捕捉。这段剧情结束后，酋雷姆会回到巨人洞窟里，成功捕捉后可以得到基因之楔。

黑版2只能得到黑暗石，白版2只能得到光芒石。

水君是一种通体蓝色、体型瘦长的四足哺乳动物，躯干上有白色的钻石形斑点。传说水君是北风的化身。它有着蓝色宝石一样的头饰，周围是白色的风一般的飘带，显现出轻盈的身姿；身上有着蓝色和白色的花纹，体现着水和风的形象。水君的面部及其暗面均为白色。水君长有象征极光的浓密的紫色髯，丝带似的尾巴向前飘舞。其口鼻部向前突出，呈白色。水君在额头部位有巨大的六角天蓝色头冠，象征着麒麟的角。水君有红色的眼睛，下颚突出，爪子小，有白色爪垫。

水君有水上行走和净化水源的能力。[3]其现身之时会莫名地吹起北风，在大地上四处奔跑。[4]水君如同北风一样四处在世界奔波，净化被污染的水质。宝可梦水晶版中说，水君是三圣兽中和凤王最亲近的。据说水君同未知图腾有联系。

宝可梦

在城都地区，若叶镇，吹起开启之风的城镇的城镇里。小智等人在森林里迷路，波克比从小霞的手中跳出，跑进草丛深处的一堂池水，皮卡丘紧跟在后，小智等人赶至时遇见了水君。

水君（动画中）

在神奥联盟飘飘球与北风的使者中，朝着百代市继续旅行的小智一行人，中途到了某个村子的宝可梦中心。那是个由乔伊小姐一家人所管理，虽然规模不大却有着开朗快乐气氛的宝可梦中心。乔伊小姐的大女儿沙耶香拥有“气球宝可梦”飘飘球，到附近跑腿办事时都会搭乘飘飘球飘去。在沙耶香出门办事的时候，小智被她妹妹小舞带到森林中的洞窟去。据说那里有她们姊妹俩的神秘好友，其实就是水君。火箭队的一系列行为，导致小智和小舞走失，在小智背小舞过独木桥时沙耶香坐在水君背上救下即将掉入峡谷的小智和小舞。

宝可梦：旅途