工藤新一
17岁，高中生侦探，就读于帝丹高中二年级B班，人称“平成年代的福尔摩斯”“日本警察的救世主”。
在和青梅竹马毛利兰一同去游乐园玩时，目睹黑衣组织成员秘密交易时而被偷袭，并被灌下名为“APTX4869”的毒药，虽然幸免于死，但身体就此缩小成7岁小学生的模样。之后寻求阿笠博士的帮助，在被小兰询问自己名字时，化名为江户川柯南。在阿笠博士的提议下，寄住于小兰的父亲、私家侦探毛利小五郎家中，秘密调查黑衣组织。
工藤新一总是把生命放在第一位。在纽约的时候，明知道面对的是银发杀人魔，还是出手救了他的性命。有正确的判断力和很强的正义感、责任感，对于犯罪行为绝不宽容，但在罪犯遇到生命危险时也会舍身相救。有时候也会露出调皮的一面，在和小兰在游乐园游玩的时候，假装推理出体操运动员衣服的颜色，实际上是自己看到了
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服部平次
大阪改方学园高中部二年级的学生，关西的高中生名侦探，和工藤新一并称“关东的工藤，关西的服部”。父亲是大阪府警本部长服部平藏，父子两人都是剑道高手。与远山和叶是青梅竹马的同班同学。深色皮肤，带着浓厚的关西腔。在调查一起案件时发现了江户川柯南的真实身份就是工藤新一，是《名侦探柯南》中第一个主动发现江户川柯南身份的人。之后成为江户川柯南（工藤新一）的好友，两人经常联手办案。
擅长推理、剑道、摩托车车技、枪械、游泳、潜水、滑雪、英语、在古董店杀价、猜女孩子的泳衣、投掷、装蒜、国际象棋、英文等。不擅长料理、足球等。自称从小到大破过1000多件案件（找小猫小狗都算进去了）。他在有案件时认真的摆正帽子（被远山和叶称为“引擎发动”），破案后会自信地转回来
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黑羽快斗
17岁，江古田高中2年B班学生。精通易容、变声、逃脱术。有一天突然发现其8年前去世的父亲黑羽盗一就是怪盗基德后，为找出杀害父亲的凶手，成为第二代怪盗基德，通过大胆的盗窃行为来调查父亲的死因。发现父亲是被神秘组织暗杀后，便与神秘组织为敌，试图瓦解其阴谋。
他有一个青梅竹马叫中森青子，但青子并不知道他就是怪盗基德。另外，中森青子的父亲——警视厅搜查二课警部中森银三一心想捉拿怪盗基德，但每次都会失败。其次想将其抓获归案的还有身为高中生侦探的同班同学白马探和众多警察。其同学小泉红子是会占卜的女学生，也曾多次帮助黑羽隐藏其怪盗基德的身份，甚至假扮其身份帮助其逃离犯罪现场，使得他人对他的怀疑度有所降低。
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安室透
本名降谷零，化名安室透。表面职业为私家侦探、波洛咖啡厅服务生，真实身份为日本公安警察派入黑衣组织的卧底，组织代号“波本”（Bourbon）
擅长搜集情报，有极强的观察力与推理能力。曾伪装成伤疤赤井来观察赤井秀一是否已死。为了调查毛利小五郎与雪莉是否有关联而接近毛利并拜毛利为师，后对柯南的身份产生了兴趣。对FBI成员进行了一系列试探，推断出赤井秀一未死和赤井假扮为冲矢昴活动。由赤井秀一揭晓其真名和日本公安警察的身份。
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赤井秀一
FBI搜查官，赤井务武与赤井玛丽的长子，羽田秀吉与世良真纯的哥哥。知晓江户川柯南的真实身份为工藤新一。
有极强的狙击能力、推理能力和情报搜集分析能力，车技一流。冷峻坚定，不苟言笑。是左撇子，平时总喜欢戴针织帽。曾化名“诸星大”卧底黑衣组织，并获得“黑麦威士忌（Rye）”的代号，后身份暴露脱离组织，被组织称为“银色子弹”。
为了帮助CIA卧底水无怜奈重回组织并取得信任，假装被枪击身亡，之后以冲矢昴的身份继续活动，暂住在工藤宅中，暗中保护灰原哀。
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