在夜间的迷雾中由路卡利欧领路，大家坐在琪朵的越野车里朝着世界初始之树而去。
随着天边见亮，琪朵停下车，让大家休整一下，顺便解决早餐。
路卡利欧在路边找了些野果充饥，在小刚准备食物的过程中，遇到了一只偷吃的野生爱哭树。
它刚开始哭就被小胜这个对小精灵颇有了解的人给拆穿了它爱假哭的个性，就立刻拿着饭盘逃走。
路卡利欧在爱哭树逃跑路上拿过饭盘，让爱哭树不可以拿别人的东西，顺便给了爱哭树野果。
爱哭树一口咬走野果，躲在岩石后面一边吃着一边偷看。
风开始吹拂，天空中厚厚的云层也开始散开露出了太阳。
阳光将周围的自然景象全部展现出来。
这个时候，被梦幻带到自己居所的皮卡丘也醒了过来，被梦幻拉着开始玩了起来，因为喵喵的无疑之举，皮卡丘和喵喵以及梦幻进入了世界初始之树的躯体之中。
这躯体中有着流动的能量球体，可以来到世界初始之树各个有出口的地方。
在解决完早餐后，一路继续前行的小智一行，被间歇泉拦住了去路，正好发现已经形成了正常的温泉，大家就干脆在等间歇泉停下前先泡泡温泉。
路卡利欧坐在岩石上，看着温泉池中泡着的众人，开始回忆起自己和亚朗曾经在温泉的一切。
没一会，小遥发现了一朵奇特的花，随着小智的靠近突然发光把小智吓了一跳，同时将其从山壁上带了下来。
可当大家泡好温泉，穿好衣服，将小智摘下的花给重新栽进地里时，小智拿在手里后，花朵突然开放，一个光球浮现，紧接着出现了小智从山壁上掉下来的景象。
从琪朵口中得知，这个为时间之花，能让波导的使者看见时间的奇迹。
在野外，大家露营时，开始小智开始聊起了自己和皮卡丘感情从不和到变好的事情。
可因为路卡利欧当年被亚朗收进权杖时，亚朗没有过多解释，而让路卡利欧误会亚朗逃跑放弃城堡时，让路卡利欧非常愤恨人类。
开始质疑小智和皮卡丘的感情，小智也开始质疑路卡利欧。
小智和路卡利欧因为理念不合甚至打了起来，一直打到滚进水里。
看着这一切发生的小梦，完全以一个看客的身份见证着这一切，他没有去劝说，因为此刻的路卡利欧已经进入了偏执的状态，在没有见到真相的时候，哪怕作为全知的小梦，说出了亚朗当年做的事情，路卡利欧也不可能相信。
同时，在梦幻的住处，梦幻还在和皮卡丘分享这自己的玩具。
在路卡利欧的带领下，大家日夜兼程，终于来到了路卡利欧被封印的地点。
正好这个地点的时间之花被路卡利欧唤醒，看到当年路卡利欧被权杖封印的时刻，以及当年古代小精灵战争的小精灵军队。
小胜猜想亚朗封印起路卡利欧，是为了保护路卡利欧。
小梦在一旁点了点头，小胜这个猜想却是正确答案，可惜路卡利欧它自己并不理解······
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